Assim como todo o Brasil, o esporte mais praticado na cidade é o futebol. A cidade possui dois clubes de futebol, o Real Brasil e o São José. Ambos jogam no Estádio do Pinhão. Além do futebol, a cidade possui uma equipe de futsal e possuía uma equipe de basquete, hoje extinta.
São José dos Pinhais possui três estádios municipais:
- Estádio do Municipal do Pinhão
- Estádio Municipal Atílio João Bortolotti
- Estádio Municipal Moacir Tomelin
A cidade possui vários ginásios de esportes:
- Centro de Esporte e Lazer Ney Braga
- Centro de Esporte e Lazer São Marcos
- Centro de Esporte e Lazer Contenda Tio Zico
- Centro de Esporte e Lazer Borda do Campo
- Centro de Esporte e Lazer Colônia Rio Grande
- Centro de Esporte e Lazer Malhada (Aluisio Mikos)
- Núcleo de Esporte e Lazer Jd S. Dumont
- Núcleo de Esporte e Lazer Cidade Jardim
- Núcleo de Esporte e Lazer Quississana
- Núcleo de Esporte e Lazer Jardim Fátima
- Núcleo de Esporte e Lazer Itagibe Quirino