A cidade é dividida em 37 bairros, sendo que os mais desenvolvidos estão localizados perto do centro (14). Como podemos ver, os bairros perto do centro são menores do que os mais afastados. A última separação de bairros em São José dos Pinhais foi em novembro de 1999.
1. Academia
2. Aeroporto
3. Afonso Pena
4. Águas Belas
5. Aristocratas
6. Arujá
7. Distrito de Campo Largo
8. Aviação
9. Barro Preto
10. Bom Jesus
11. Boneca do Iguaçu
12. Borda do Campo
13. Campo Largo da Roseira
14. Centro
15. Cidade Jardim
16. Colônia Rio Grande
17. Contenda
18. Costeira
19. Cruzeiro
20. Del Rey
21. Fabíola
22. Guatupê
23. Iná
24. Independência
25. Ipê
26. Itália
27. Ouro Fino
28. Parque Iguaçu
29. Pedro Moro
30. Quississana
31. Renault
32. Rio Pequeno
33. São Cristóvão
34. São Domingos
35. São Marcos
36. São Pedro
37. Zaniolo
